スペクトロスコピーデータのポストプロセスを行うプラグインとしてEELSのエネルギー分解能向上を行うDeConvEELSや、多変量解析によるノイズ除去を行うMSA、マルチフレームのSTEM-SIデータのスキャン歪補正によるS/Nの向上を行うSmartAlignなどがあります。また、QEDではALCHEMIデータの自動取得化が可能です。
- DeConvEELS (EELS Deconvolution)
DeConvEELSは最大エントロピー法またはRichardson-Lucy法により、ローロスまたはゼロロススペクトルを装置関数としてデコンボリューションを実行することにより、電子エネルギー損失スペクトル（EELS）のエネルギー分解能を向上させます。 - MSA (Multivariate Statistical Analysis)
MSAは最も一般的な多変量統計分析法であるPCA（主成分分析法）に基づいて、SI（スペクトル像）データからランダムノイズを大幅に除去し、各スペクトルを明瞭にします。
- SmartAlign (Scan-distortion Compensator)
SmartAlignは2D STEM像に対して決定された歪み情報を適用することにより、SI（スペクトル像）データのステージ/スキャンドリフトおよびスキャン歪みを補正します。 - QED (Quantitative Electron Diffraction) for ALCHEMI
QEDは電子ビーム方向を制御しながらALCHEMIのためのEELSおよび/またはEDXスペクトルを取得します。